Держказначейство наказом від 06.12.2012 р. № 367 затвердило Порядок організації роботи органів ГКСУ в процесі казначейського обслуговування місцевих бюджетів.
Згідно з документом органи казначейства приймають від головних розпорядників засобів місцевих бюджетів і розпорядників бюджетних коштів нижчого рівня мережа розпорядників нижчого рівня і одержувачів бюджетних коштів.
Якщо місцевий бюджет не затверджений у встановлений законодавством термін, органи казначейства реєструють показники тимчасових розписів місцевих бюджетів, наданих місцевими фінорганами, про що на оригіналі розпису ставиться відбиток штампу "Зареєстровано і поставлено на облік".
Органи казначейства здійснюють розрахунково-касове обслуговування розпорядників бюджетних коштів шляхом проведення платежів з реєстраційних, спеціальних реєстраційних рахунків розпорядників і рахунків одержувачів бюджетних коштів, відкритих в органах казначейства згідно кошторисів, планів асигнувань загального фонду місцевих бюджетів, планів спеціального фонду місцевих бюджетів або планів використання бюджетних коштів, планів надання кредитів.
Крім того, органи казначейства уповноважені здійснювати контроль за наявністю асигнувань для узяття бюджетних зобов'язань і відповідністю узятих бюджетних зобов'язань певним асигнуванням по відповідних кодах економічної класифікації витрат.
У разі проведення розрахунків на умовах авансування розпорядниками і одержувачами бюджетних коштів органи казначейства здійснюють контроль за дотриманням терміну надання підтверджувальних документів про отримання товарів, виконання робіт, надання послуг розпорядниками і одержувачами бюджетних коштів.
Органи казначейства отримують від фінансових органів довідки про взаємні розрахунки, акти звіряння між учасниками і рішення місцевої ради відносно взаємних розрахунків у частині міжбюджетних стосунків.
При передачі з одного місцевого бюджету планових і фактичних показників бюджетних установ, організацій і заходів до іншого бюджету органи казначейства, згідно з наданими місцевими фінансовими органами довідок, відбивають в обліку зміни за плановими і фактичними показниками відповідного місцевого бюджету. При цьому зменшується річний об'єм планових і фактичних показників місцевого бюджету, який передає, і відповідно збільшується річний об'єм планових і фактичних показників місцевого бюджету, якому передають вказані показники по відповідних кодах бюджетної класифікації.
Операції за поданням кредитів здійснюються шляхом проведення платежів з реєстраційних, спеціальних реєстраційних рахунків кредиторів, відкритих в органах казначейства, згідно кошторисів і планів надання кредитів із загального фонду місцевих бюджетів, планів спеціального фонду місцевих бюджетів (за винятком власних надходжень і відповідних витрат) або планів використання бюджетних коштів відповідно до умов кредитних договорів.
Відповідно до покладених завдань органи казначейства контролюють цільовий напрям бюджетних коштів на стадії проведення оплати на підставі підтверджувальних документів, наданих кредиторами.