Одночасно з Ліцензійним умовами по виробництву і торгівлі ліками (см "Набувають чинності нові Ліцензійні умови по виробництву і торгівлі ліками") набув чинності 22 листопада 2010 року і Порядок контролю за їх дотриманням.
Відповідно до Порядку контроль здійснюється органом ліцензування шляхом проведення планових і позапланових перевірок. Перші проводяться згідно із затвердженим планом (публікованому на офіційному сайті Інспекції). Позапланові - на підставах, вказаних в Законах "Про ліцензування певних видів господарської діяльності" і "Про основні начала державного нагляду (контролю) у сфері господарської діяльності".
Термін тривалості планових перевірок не може перевищувати 15 робочих днів (для малого підприємництва - 5), позапланових, - 10 робочих днів (для малого підприємництва - 2). Продовження термінів не допускається.
В порядку перераховані права перевіряючих і таких, що перевіряються (ліцензіатів). Зокрема, закріплено право ліцензіата не допускати на перевірку орган контролюякщо порушуються законодавчі вимоги про періодичність перевірок, а також якщо перевіряючі не надають копій необхідних для перевірки документів, а надані документи не відповідають закону.
Посадовці перевіряючого органу перед перевіркою зобов'язані пред'явити посвідчення на проведення перевіркивидавані на основі наказу. При позаплановій перевірці пред'явленню підлягає і документ, що вказує на основу її проведення, копія якого вручається ліцензіату.
Порядком детально розписана процедура ходу перевірки і оформлення її результатів, а також підстави для вирішення про анулювання ліцензії і порядок його оскарження.