Відповідно до пункту 4.1 розділу IV Порядку ведення і використання міжвідомчої бази цих зареєстрованих в Україні лікарських засобів основою для митного оформлення лікарських засобів являється наявність інформації про те, що лікарський засіб включений в Державний реєстр лікарських засобів України. Про це нагадав Мінохоронздоров'я в листі від 4 жовтня 2013 року № 18.01-05/6868/30772.
Мінохоронздоров'я роз'яснило, що згідно ст. 17 Закону "Про лікарські засоби" на територію України можуть ввозитися лікарські засоби, зареєстровані в Україні. Міжвідомча база цих зареєстрованих в Україні лікарських засобів - це база даних, що містить відомості про зареєстровані в Україні лікарські засоби, яка ведеться Мінохоронздоров'я. Основою бази даних є інформація, яка міститься в Державному реєстрі лікарських засобів України і подається Мінохоронздоров'я в електронному вигляді і на паперовому носії з супровідним листом в Держмитслужбу. З 1 липня 2012 року ця інформація подається в електронному вигляді в режимі реального часу.
Згідно з пунктом 197.1.27 ст. 197 Податкового кодексу звільняються від оподаткування операції з поставки лікарських засобів, дозволених для виробництва і застосування в Україні і внесених в Державний реєстр лікарських засобів (у тому числі аптечними установами), а також виробів медичного призначення по переліку, затвердженому Кабміном.
