Для проведення розслідування керівник держоргану створює комісію в складі не менше 7 чоловік, яку очолює голова. До роботи комісії не притягуються посадовці держоргану, де працює людина, відносно якої проводиться таке розслідування, якщо їх залучення може привести до виникнення конфлікту інтересів. Розслідування проводиться на протязі 10 днів а у разі потреби термін можна продовжити не більше ніж до 20 робочих днів. Члени комісії у разі потреби можуть з відома особи, відносно якої проводиться службове розслідування, застосовувати аудіо- і відеозасобу з метою фіксації його пояснень.
Голова і члени комісії несуть персональну відповідальність за повноту, всебічність і об'єктивність укладення і нерозголошування інформації, що стосується відповідного розслідування. При визначенні рекомендованого виду дисциплінарного стягнення враховується ступінь тяжкості досконалої провини, заподіяний ним збиток і обставини, при яких здійснена провина.
У разі виявлення за результатами службового розслідування ознак злочину або адміністративного правопорушення суб'єкт призначення зобов'язаний впродовж 3 робочих днів передать матеріали у правоохоронні органи.
Знімати копії або робити виписки з укладення до представлення його на розгляд суб'єктові призначенні особи, відносно якої проводиться службове розслідування забороняється. Рішення за результатами службового розслідування може бути оскаржене в порядку, визначеному законом.
По анонімних повідомленнях службове розслідування не проводиться.
Постанова Кабміну від 25.07.2012 р. № 666, яким затверджений порядок, набуде чинності одночасно з Законом "Про державну службутобто, з 1 січня 2013 року.