В приказе от 7 ноября № 355 Госфининспекция определила подразделения, ответственные за организацию проверки в соответствии с Законом об очищении власти.
Управление по работе с персоналом отвечает за информирование должностных лиц о начале люстрации и обнародование соответствующих данных на сайте Госфининспекции. Управление получает заявления о люстрации, проверяет достоверность указанных в них сведений и направляет запросы в органы проверки. Далее всю информацию, полученную от органов проверки, обрабатывает Сектор по вопросам предотвращения и выявления коррупции вместе с Управлением внутреннего аудита.
Правовое сопровождение проверки контролирует юридический департамент. Техподдержку сайта в плане создания отдельного раздела по люстрации обеспечивает Управление информационных технологий. А Департамент стратегического планирования, взаимодействия со СМИ и связей с общественностью отвечает за своевременное размещение данных проверки на сайте.