Президент Указом № 141/2013 затвердив Положення про Міністерство прибутків і зборів України, згідно з яким встановлюється, що до прийняття законодавчих і інших нормативно-правових актів у складі Миндоходов і його територіальних органів утворюються і діють підрозділи податкової міліції.
До територіальних органів Міністерства відносяться його територіальні органи в АРК, областях, м. Києві і Севастополі, міжрегіональні територіальні органи, митниці, спеціалізовані департаменти і спеціалізовані органи Миндоходов, державні податкові інспекції в районах, містах (окрім м. Києва і Севастополя), районах в містах, об'єднані і спеціалізовані державні податкові інспекції.
Гранична чисельність працівників Міністерства і структура його апарату України затверджується Кабміном.
Згідно з документом основними завданнями Міністерства являються забезпечення формування і реалізація :
1) єдиної державної податкової, митної політики в частині адміністрування податків і зборів, митних платежів, а також боротьба з правопорушеннями при застосуванні податкового і митного законодавства, здійснення в межах своїх повноважень контролю за надходженням до бюджетів і державних цільових фондів податків і зборів і інших платежів;
2) державна політика у сфері контролю за виробництвом і зверненням спирту, алкогольних напоїв і тютюнових виробів;
3) державна політика по адмініструванню єдиного внеску, а також боротьба з правопорушеннями при застосуванні законодавства з питань сплати єдиного внеску;
4) державна політика у сфері контролю за своєчасністю здійснення розрахунків в іноземній валюті у встановлений законом термін, дотриманням порядку проведення готівкових розрахунків за товари (послуги), а також за наявністю ліцензій на здійснення видів господарської діяльності, що підлягають ліцензуванню відповідно до закону, торгових патентів.