У листі від 27.12.2012 р. № 12699/0/71-12/15-2117 ДПС роз'яснила особливості адміністрування екологічного податку в 2013 році.
Податкова вказала, що з 01.01.2013 р. усувається подвійне оподаткування екологічним податком розміщення суб'єктами господарювання відходів на спеціально відведених місцях або об'єктах, розташованих на власних територіях, а відповідно, при тимчасовому зберіганні відходів суб'єкти господарювання не платитимуть екологічний податок за наявності у них договори на видалення і утилізацію відходів з суб'єктами господарювання (комунальними або спеціалізованими підприємствами і так далі) і передачі відходів у встановлені цим договором терміни, на утилізацію і поховання.
Також врегульовано питання відносно несплати екологічного податку за об'єми і види (класи) відходів як вторинної сировини, розміщуваних на власних територіях (об'єктах) суб'єктів господарювання (незалежно від наявності ліцензії на збір і заготівлю окремих видів відходів як вторинної сировини).
Законом № 5503 з 01.01.2013 р. змінені ставки екологічного податку, передбачені статтею 243 - 248 Податкового кодексуа саме вони збільшені в середньому на 7,9%.
При цьому ДПС відмітила, що згідно з пунктом 2 підрозділи 5 розділу XX "Перехідні положення" НК по податкових зобов'язаннях по екологічному податку, що виникли з 01.01.2013 р. до 31.12.2013 р. включно, ставки податку складають 75% від ставок, передбачених статтями 243 - 246 НК (у 2012 р. - складали 50%).
Крім того, податкова вказала, що пунктом 51 розділу VI "Завершальні і перехідні положення" Бюджетного кодексу встановлено, що екологічний податок (окрім податку, що стягується за утворення радіоактивних відходів (включаючи вже накопичені) і / або тимчасове зберігання радіоактивних відходів їх виробниками понад встановлене особливими умовами ліцензії терміну) зараховується в 2013 р. в таких пропорціях:
- до спеціального фонду державного бюджету - 53% (у 2012 р. - 30%), з них 33% з напрямом на финобеспечение виключно цільових проектів екологічної модернізації підприємств в межах сум сплаченого ними эконалога у встановленому Кабміном порядку;
- до спеціального фонду місцевих бюджетів - 47% (у 2012 р. - 70%), у тому числі: до сільських, селищних, міських бюджетів - 33,5%, обласних бюджетів і бюджету АРК - 13,5%, бюджетів міст Києва і Севастополя - 47%.