У наказі Генпрокуратури від 29 серпня 2014 року № 12гн "Про особливості діяльності військових прокуратур" передбачені умови забезпечення діяльності і розмежування компетенції військових прокуратур.
Контролем і підвищенням ефективності військових прокуратур повинна займатися Головна військова прокуратура (діє на правах підрозділу ГПУ). Її нагляд поширюється і на органи військового управління (окрім видів Збройних Сил).
Військові прокурори повинні забезпечувати нагляд за дотриманням і застосуванням законів по військових прокуратурах Центрального, Південного і Західного регіонів. У своїх наказах вони розмежовують власні повноваження і підпорядкованих військових прокурорів.
В умовах введення надзвичайного, воєнного стану або проведення АТО із залученням військових формувань, місцем постійної дислокації яких являється територія в межах військового гарнізону, - особовий склад військових прокуратур може вирушати в райони розташування цих з'єднань.
Діяльність військових прокурорів передусім спрямована на визначені в наказі питання військової справи. В межах компетенції військові прокуратури здійснюють нагляд за дотриманням законів і розслідування карних правопорушень у військовій сфері, координують діяльність військових формувань. Також вони проводять особистий прийом засуджених, що містяться у батальйоні, на гауптвахтах Військової служби правопорядку у Збройних Силах.
Суперечки про перебування під слідством вирішуються прокурорами обласного рівня, а якщо прокурори не прийшли до згоди, - заступником Генпрокурора (Головним військовим прокурором).
Що стосується процесуальних моментів, то у разі отримання відомостей про наявність підстав для застосування прокурорських представницьких повноважень позови до суду спрямовуються за підписом керівництва прокуратур усіх рівнів. А позови в інтересах держави в особі центральних органів виконавчої влади пред'являються військовим прокурорам регіонів і підлеглим ним військовим прокурорам. Їм забезпечується участь в розгляді справ в судах першої інстанції по їх позовах і вступ в розгляд справ, в яких сторони і предмет суперечки відносяться до закріпленого за ними напряму діяльності.
Апеляційні скарги подаються керівникам прокуратур. Військовим прокурорам, у свою чергу, повинна забезпечуватися участь в розгляді апеляцій.
Касаційні скарги вносяться військовим прокурорам, які пред'являли позови, або за узгодженням з ними прокурорам, які брали участь в розгляді справ в апеляційних судах.
Закон про створення військових прокуратур набув чинності 24 серпня 2014 року.
