Приказом от 13.02.2013 г. № 48 ГТС прекратила путем присоединения к Миндоходов такие специализированные таможенные органы:
- Департамент развития таможенной инфраструктуры и международного сотрудничества;
- Департамент борьбы с контрабандой и таможенными правонарушениями;
- Департамент таможенных информационных технологий и статистики;
- Департамент таможенного аудита, анализа и управления рисками;
Также прекращено путем присоединения Автотранспортное таможенное хозяйство.
Установлено, что указанные органы и таможенная организация будут выполнять свои функции до отдельного распоряжения.
Департаменту организации таможенного контроля и оформления поручено обеспечить направление предложений в Минфин для внесения соответствующих изменений в Классификатор таможенных органов, их структурных подразделений, таможенных организаций, специализированных учебных заведений и научно-исследовательского учреждения таможенной службы Украины.