ВХСУ в письме от 22.01.2013 г. № 01-06/86/2013 разъяснил, что стоимость любой услуги, работы, товара включает в себя НДС и наличие между сторонами спора о взыскании задолженности за предоставленные услуги, в том числе и относительно правильности определения истцом стоимости предоставленных услуг, не меняет правовой природы отношений между сторонами по делу, возникших из хозяйственного договора, именно как хозяйственных. Следовательно, с учетом того, что исковые требования связаны с обоснованностью цены за услуги, предоставленные на основании хозяйственного договора, а также учитывая, что сторонами в споре выступают субъекты хозяйствования, соответствующие споры подлежат рассмотрению хозяйственными судами.
Суд указал, что в решении споров, связанных с взысканием сумм НДС, включенных в суммы сбора и платы за услуги, которые предоставляются в морских торговых портах, следует учитывать, что основанием для освобождения от налогообложения НДС согласно с. 197 Налогового кодекса есть подтвержденное надлежащими доказательствами осуществление судном международной перевозки пассажиров, их багажа, грузов и международных отправлений, пересечение государственной границы Украины и соответствующее таможенное оформление.
В случае предоставления услуг, связанных с транзитной перевозкой грузов, основанием применения пункта 197.8 статьи 197 НК, освобождающего от налогообложения операции по поставке услуг по перевозке (перемещению) пассажиров и грузов транзитом через таможенную территорию Украины, а также по поставке услуг, связанных с такой перевозкой (перемещением), - является подтверждение того, что одной из сторон договора, на основании которого предоставляются такие услуги, является грузовладелец (получатель транзитных услуг).
Отмечено, что надлежащими доказательствами перевозки (перемещения) судами пассажиров транзитом через таможенную территорию Украины являются документы, свидетельствующие о пересечении пассажирами судов государственной границы Украины с прибытием из иностранного порта, заходом в нескольких портов Украины и выбытия в иностранный порт и содержащие сведения о предыдущих и последующих после украинских иностранных портах заходов этих судов, количестве пассажиров. Факт предоставления услуг по перевозке (перемещению) пассажиров транзитом через таможенную территорию Украины, а также по поставке услуг, связанных с такой перевозкой (перемещением), может подтверждаться, в частности, списками пассажиров с отметками Госпогранслужбы об осуществлении пограничного контроля и с отметками о пересечении государственной границы Украины, а также общими (генеральными) декларациями по этим судам.
Кроме того, указано, что на товары (кроме подакцизных), которые перемещаются транзитом морским и речным транспортом в контейнерах и во время хранения остаются в пределах одного пункта пропуска или зоны таможенного контроля морского порта, грузовая таможенная декларация не подается; в то же время таможенное оформление транзита подакцизных грузов любым видом транспорта осуществляется исключительно при условии предоставления таможенным органам грузовой таможенной декларации.
Вместе с тем, учитывая обязательность, в частности, предоставления услуг по лоцманской проводке и регулированию движения судов при осуществлении транзитной перевозки пассажиров и грузов через порты, эти услуги являются связанными с транзитной перевозкой, а значит, согласно пункту 197.8 ст. 197 НК освобождаются от обложения НДС. Такое освобождение от налогообложения осуществляется независимо от наличия или отсутствия груза на судне во время нахождения его в международном рейсе и движения «в балласте» (без груза) до или из порта Украины для загрузки или выгрузки, пересечения при этом границы Украины и проведения таможенных процедур.