Повноваженнями Мінюсту визначено:
- забезпечення здійснення оперативно-розшуковій діяльності оперативними підрозділами органів і установ виконання покарань і слідчих ізоляторів Державної карно-старанної служби;
- забезпечення здійснення досудового розслідування злочинів, здійснених на території або в приміщеннях Державної карно-старанної служби.
Відповідні зміни внесені постановою КМУ від 11 січня 2017 року № 11 у пункт 4 Положення про Міністерство юстиції України з метою приведення його у відповідність з вимогами Закону про ВСП і Закону про ОРД. Згідно з цими законами, органам ГУИС надані повноваження здійснювати досудове розслідування злочинів, здійснених на території або в приміщеннях ГУИС.