Наказом Генпрокуратури від 23.12.2015 № 414 затверджений Порядок організації діяльності органів прокуратури у зв'язку з тимчасовою окупацією території Автономної Республіки Крим і міста Севастополя.
Для захисту прав і свобод людини, інтересів суспільства і держави в умовах тимчасової окупації перший заступник, заступники Генпрокурора, заступник Генпрокурора - Головний військовий прокурор, керівники регіональних, місцевих і військових прокуратур забезпечують:
- виконання функцій прокуратури по підтримці державного звинувачення в суді, представництву інтересів громадянина або держави в суді у випадках, визначених Законом "Про прокуратуру"функцій нагляду за дотриманням законів органами, які проводять оперативно-розшукову діяльність, дізнання і досудове слідство, нагляду за дотриманням законів при виконанні судових рішень в кримінальних справах, а також при застосуванні інших заходів примусового характеру, пов'язаних з обмеженням особистої свободи громадян;
- постійний моніторинг інформації про стан виконання функцій, покладених на прокуратуру, на тимчасово окупованій території;
- своєчасне, повне, об'єктивне і якісне розгляд звернень громадян, що проживають на тимчасово окупованій території, або переселенців, їх особистий прийом;
- освітлення діяльності органів прокуратури відносно захисту прав і свобод громадян, що проживають на тимчасово окупованій території або переселенців, і загальних інтересів суспільства і держави.
Функції прокуратури Севастополя покладаються на прокуратуру Автономної Республіки Крим.